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DYNAMO - Dynamique environnementale et micro-organisme
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Publications scientifiques de l'unité ECOBIO UMR CNRS 6553 : équipe DYNAMO
Derniers dépôts (texte intégral)
Amandine Lê Van, Achim Quaiser, Marie Duhamel, Sophie Michon-Coudouel, Alexis Dufresne, et al.. Ecophylogeny of the endospheric root fungal microbiome of co-occurring Agrostis stolonifera.
PeerJ
, 2017, 5, pp.e3454.
⟨10.7717/peerj.3454⟩
.
⟨hal-01555396⟩
Cécile Klein, Pascal Claquin, Alexandrine Pannard, Camille Napoléon, Bertrand Le Roy, et al.. Dynamics of soluble extracellular polymeric substances and transparent exopolymer particle pools in coastal ecosystems..
Marine Ecology Progress Series
, 2011, 427, pp.13-27.
⟨10.3354/meps09049⟩
.
⟨hal-00597386⟩
Nathan Vannier, Anne‐kristel Bittebière, Cendrine Mony, Philippe Vandenkoornhuyse. Root endophytic fungi impact host plant biomass and respond to plant composition at varying spatio-temporal scales.
Fungal Ecology
, 2020, 44, pp.100907.
⟨10.1016/j.funeco.2019.100907⟩
.
⟨hal-02492027⟩
Achim Quaiser, Alexis Dufresne, Flore Ballaud, Simon Roux, Yvan Zivanovic, et al.. Diversity and comparative genomics of Microviridae in Sphagnum-dominated peatlands.
Frontiers in Microbiology
, 2015, 6, pp.375.
⟨10.3389/fmicb.2015.00375⟩
.
⟨hal-01149546⟩
Flore Ballaud, Alexis Dufresne, Andre-Jean Francez, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando, et al.. Dynamics of Viral Abundance and Diversity in a Sphagnum-Dominated Peatland: Temporal Fluctuations Prevail Over Habitat.
Frontiers in Microbiology
, 2016, 6, pp.1494.
⟨10.3389/fmicb.2015.01494⟩
.
⟨hal-01263117⟩
Nathan Vannier, Anne‐kristel Bittebière, Philippe Vandenkoornhuyse, Cendrine Mony. AM fungi patchiness and the clonal growth of Glechoma hederacea in heterogeneous environments.
Scientific Reports
, 2016, 6 (1), pp.37852.
⟨10.1038/srep37852⟩
.
⟨hal-01432093⟩
Nathan Vannier, Cendrine Mony, Anne‐kristel Bittebière, Philippe Vandenkoornhuyse. Epigenetic Mechanisms and Microbiota as a Toolbox for Plant Phenotypic Adjustment to Environment.
Frontiers in Plant Science
, 2015, 6, pp.1159.
⟨10.3389/fpls.2015.01159⟩
.
⟨hal-01259236⟩
Alix Mas, Yvan Lagadeuc, Philippe Vandenkoornhuyse. Reflections on the Predictability of Evolution: Toward a Conceptual Framework.
iScience
, 2020, 23 (11), pp.101736.
⟨10.1016/j.isci.2020.101736⟩
.
⟨hal-03037451⟩
Alexandre Thibault, Sylvie Derenne, Edith Parlanti, Christelle Anquetil, Mahaut Sourzac, et al.. Dynamics of organic matter in the Seine Estuary (France): Bulk and structural approaches.
Marine Chemistry
, 2019, 212, pp.108-119.
⟨10.1016/j.marchem.2019.04.007⟩
.
⟨hal-03148868⟩
Denis Faure, Patricia Bonin, Robert Duran, Pierre Amato, Florence Arsene-Ploetze, et al.. Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues.
Environmental Science and Pollution Research
, 2015, 22 (18), pp.13577-13598.
⟨10.1007/s11356-015-5164-5⟩
.
⟨hal-01247096⟩
Mots-clés
16S/18SrRNA
Metagenomic
Nitrate
Nitrate reduction
Abundance
Nutrients
Nitrite
Cooperation
Biogeochemistry
Vivianite
Riparian zone
Bog
Ammonium
Holobiont
Modeling
Modelling
Fungi
ARNr18S
Mineralization
16S rRNA and hzo genes
Fractured aquifers
Hyporheic zone
ATBI
BIODIVERSITY
Fen
ENVIRONMENTS
Carbon
Riparian buffers
Surface water
Microbial ecotoxicology
Sediment
Phosphorus
MID-ATLANTIC RIDGE
Clonal plants
Earthworms
Community
15N labelling
Catchment hydrology
Bacteria
Denitrification enzyme activity
Interactions
Transparent exopolymer particles
Hydrological flowpaths
16S rRNA gene
Inter-catchment comparison
Residence time distribution
Plant
ARNr 18S
Endophytes
Denitrification
Heterogeneous environment
Nitrogen
Biodiversity
Rivière
Ecohydrology
Ecosystem functioning
Watershed
EUKARYOTIC DIVERSITY
18S rRNA
Danube River
T-RFLP
Plant microbiota
Environmental genomics
River
Mutualism
Community structure
Gallionellaceae
Champignons
Biogeochemical processes
Land use
Diversité
Abondance
Wastewater treatment
Anammox
16S rRNA
Pyrosequencing
Floodplains
AMINO-ACID-UPTAKE
Peat
Plant microbiome
20-bipyridine
ATLANTIC-OCEAN
Nutrient
Hydrology
ACL
Symbiosis
Connectivity
Organic matter
Groundwater
Evolution
Diversity
Microbiota
Estuary
Phytoplancton
Nitrification
Phytoplankton
Métagénomique
18SrRNA
Community assembly
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