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Références bibliographiques

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Mots-clés

Bioproduction Child Abasic nucleoside analogues Expérimentations in virtuo Analytical Image segmentation Metabolism Belief propagation Humans DNA extraction Graph-based reconstruction 450-DEGREES-C ISOTHERM Feature selection Child Preschool Eukaryotic genome Fermentation processes EM algorithm Asymmetry Circuits DNA isotope labeling Genes encode Cell-free system Evolution Infant DNA replication Enzymatic synthesis Aptamers Frog Cell cycle Cocaine Retrosynthesis Inference Dna replication Autolysin Copper complex Transcriptome DNA origami DNA polymerases D-psicose Metabolic engineering Gene regulatory networks Biosensor Nucleoside triphosphate Molecular Biology DNA supercoiling Cancer-cells Heterogeneity Protein Computer-aided design Biosynthetic pathway Fork-join AL-ZN SYSTEM Chemistry Modelling Escherichia-coli Bacteria Genetic Algorithms Cell wall Data Reduction Enzyme kinetics Life Sciences Biophysique Chemicals Biomanufacturing processes Biotechnology Coenzyme-a Drug delivery DNA segregation Development Homeostasis Biosynthetic pathways In vitro synthetic biology Cell-free optimization Attributes Selection Systems Biology BAC library Gene Expression Regulation Circuit Gene regulation Female DNA Gaussian process regression Synthetic Biology Biochemistry Amphibian Enzyme screening Hippuric-acid Inducer Deregulation Cell-free protein synthesis Biophysics Automatic method Hairpin structures Biosynthesis Genomics Biosensors Synthetic biology Decision Trees Design Cancer systems biology

Bienvenue dans la collection des publications de l'Institut de Biologie Systémique et Synthétique

Présentation des activités

Le projet commun de l'iSSB vise à concevoir, construire et caractériser des circuits génétiques inédits insérés dans des bactéries, pour comprendre et contrôler la régulation génétique. Son domaine d’application future est la santé, notamment la synthèse contrôlée dans le temps de molécules thérapeutiques par des systèmes biologiques reprogrammés. Les recherches de l'iSSB combinent des approches théoriques, informatiques et expérimentales.

Thèmes de recherche

  • Approches de rétrosynthèse à l’interface chimie-biologie, appliquées à la production rationnelle de molécules d'intérêt chimique et thérapeutique par ingénierie métabolique.
  • Conception et synthèse de dispositifs régulateurs de l'expression génétique au niveau de la transcription et de la traduction ; développement d'une plateforme micro et milli-fluidique pour la validation et l'évolution in vivo des circuits de régulation synthétiques introduits dans des bactéries.
  • Étude de l’architecture des génomes et de son influence sur la régulation de l'expression des gènes. Une meilleure connaissance de l'organisation fonctionnelle des génomes est nécessaire à l'introduction rationnelle de circuits génétiques synthétiques dans les micro-organismes.
  • Élaboration d'outils permettant de synthétiser et répliquer des acides nucléiques artificiels (XNA) qui n'interfèrent pas avec les systèmes naturels. A terme, l'objectif est de fabriquer des micro-organismes utilisables par l'industrie, incapables de disséminer de l'information génétique vers les espèces naturelles ni d'en recevoir de ces dernières.

 

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